Kuruluşumuzun idari yapılanması, BOTAŞ Genel Müdürlüğü merkez olmak üzere Bölge Müdürlükleri ve İşletme Müdürlüklerinden oluşmaktadır. Doğal gaz faaliyetleri kapsamında ülke genelinde merkezleri Ankara, İstanbul, Kayseri ve Erzurum’da bulunan 4 Bölge Müdürlüğü ve bu bölge müdürlüklerine bağlı Orta Anadolu, Ege, Güney Marmara, Trakya, Akdeniz, Karadeniz ve Güneydoğu Anadolu olmak üzere 7 İşletme Müdürlüğü bulunmaktadır. Ayrıca boru hatlarının geçtiği güzergâh üzerinde kamulaştırma irtibat büroları, kısım şeflikleri, RMS-RMA istasyonları ve kompresör istasyonları bulunmaktadır. Ayrıca, LNG faaliyetlerine ilişkin Tekirdağ/Marmaraereğlisi’nde LNG İşletme Müdürlüğü, Hatay/Dörtyol’da FSRU terminali, doğal gaz depolama faaliyetleri kapsamında ise Silivri ve Tuz Gölü İşletme Müdürlükleri bulunmaktadır.

Petrol faaliyetlerimize ilişkin olarak, Adana/Ceyhan'da Petrol İşletmeleri Bölge Müdürlüğümüz bulunmaktadır. Petrol taşımacılığı alanında; Irak-Türkiye, Ceyhan-Kırıkkale, Batman-Dörtyol ve Dörtyol-Ceyhan Ham Petrol Boru Hatları işletilerek hizmet vermektedir